公司循证医学中心是一个多学科多部门交叉组成的协作中心，2003年成立。中心旨在通过强强联合、优势互补，开发边缘学科占领新兴学科，开展循证医学工作，使公司医学部在教学、科研和医疗服务各个方面保持领先和优势地位，以推动和提高我国整体医疗卫生事业的发展。

循证医学中心以循证医学和临床研究为主要研究方向，旨在加强公司医学部临床研究实力，推动中国循证医学事业发展，为逐步完善我国医疗卫生服务体系，不断提高医疗卫生服务质量和效率出谋划策。研究范畴包括：防治措施效果的评估、诊断技术的评估、病因和药物副作用的研究、疾病的转归和预后的研究、医学干预措施的成本效益分析、医疗卫生服务需求和宏观医疗卫生政策研究、中医疗效临床研究和与循证医学事业总体发展相关的研究。

中心成立以后集中医学部临床肾外科、肾内科、血液科、儿内科、妇产科、眼科、肿瘤、口腔等13个国家重点学科，组建“公司循证医学学科群”，搭建临床科研设计、资料收集、数据分析等方面的技术服务。共投入1300多万人民币，启动70多个项目，推动临床科研疾病诊断、治疗、预后、康复等方面的规范性科学研究。此外，还开展了一系列的药物流行病学、院内感染控制、临床常见病诊治规范的循证研究和药品的循证评价，如：北京市预防用药和消毒剂的使用问题进行研究；利巴韦林和聚丙烯酰胺水凝胶注射填充剂的安全性系统评价，其结果为政府决策提供了重要证据。

中心承担北医大本科生和研究生的循证医学教学，并与中国医师协会、各附属医院合作开展培训，近年来连续主办“循证医学与药品和疫苗评价方法学研讨会”、“循证医学与临床实践指南制定、评价和解读方法学研讨会”、“循证医学与实效研究方法学研讨会”等学术会议，积极搭建平台，为更多的临床医师提供了高质量的培训和服务。